Ο Παράκελσος θεωρεί την αλχημεία ένα από τα απαραίτητα θεμέλια της ιατρικής, όπως αναπτύσσει διεξοδικά στο βιβλίο του Paragrarum, αλλά και στο Labyrinthous Medicorum Errantium, παρ’ όλον ότι βρίσκεται στην ανάγκη να την υπερασπιστεί από τις κατηγορίες που, όπως φαίνεται διατυπώνονταν σε μεγάλη έκταση εναντίον της από την εποχή ήδη εκείνη. Αυτό που διαφοροποιεί τον Παράκελσο από άλλους προγενέστερους αλλά και μεταγενέστερους αλχημιστές, ή υποστηρικτές της αλχημείας είναι ότι καθορίζει με σαφήνεια ως πρακτικό στόχο της αλχημείας εκείνον της παρασκευής φαρμάκων και όχι της παρασκευής χρυσού.