Ο Πυθαγόρας γεννήθηκε μεταξύ 580 και 570 π.Χ. στην Σάμο και είναι σύγχρονος του πρώτου Βούδα, του Γκαουτάμα Σιντάρτα, καθώς και του Κομφούκιου. Η πατρική περιουσία, του επιτρέπει να αποκτήσει μία καλή μόρφωση κοντά σε σοφούς καθηγητές που ζούσαν στην Σάμο ή την Ιωνία την εποχή εκείνη, όπως οι Αναξίμανδρος, Θαλής, Φερεκύδης και Αναξιμένης. Η προσωπική του νοημοσύνη, του δίνει την δυνατότητα να αφομοιώσει την διδασκαλία αυτή και γίνεται τάχιστα βαθύς γνώστης της φιλοσοφίας, των μαθηματικών, της ποίησης και της μουσικής.
Η οικογενειακή του περιουσία, του επιτρέπει επίσης να ταξιδέψει σε πολλές χώρες για να τελειοποιήσει τις φιλοσοφικές του γνώσεις και να έρθει σε επαφή με διάφορα ρεύματα και θεωρίες του μυστικισμού. Τον βρίσκουμε σε ηλικία είκοσι ετών στην Ηλιούπολη της Αιγύπτου, όπου μυείται στα Μυστήρια της Ίσιδος. Ο Πλούταρχος, στο σύγγραμμά του Ίσις και Όσιρις, μας πληροφορεί ότι και άλλοι Σοφοί, όπως οι Σόλων, Θαλής, Δημόκριτος και Πλάτων, έκαναν ανάλογο μυητικό ταξίδι στην Αίγυπτο.